Hormis le secrétariat de la Délégation Générale (secrétariat de la DG, Service Relation Publique et le Centre Médical) qui fonctionne avec indépendance, les Départements Centraux sont repartis de la manière suivante :
- Département Contrôle des Importations (DCI)
- Département Contrôle des Exportation (DCE)
- Département des Laboratoire (DL)
- Département Marketing (DMARK)
- Département Normalisation (DNOR)
- Département Logistique (DLOG)
- Département Coordination (DCOOR)
- Département Commissariat d’Avaries (DCA)
- Département Contrôle Environnement (DEnv)
- Département Contrôles Techniques (DCT)
- Département Métrologie (DM)
- Département Financier (DF)
- Département Administratif (DA)
- Département de Systèmes d’Information (DSI)
- Département Planification et Développement (DPD)
- Département d’Audit interne (DAI)
- Département Juridique (DJ)
- Département des Hydrocarbures (DHydr)
- Département Certification Production Local (DCPL)
- Département de Secrétariat de la Direction Générale (DSDG)